1、口岸监管部门发出卫生处理指令，向企业（船代/货代/自理企业）下达《检疫处理通知书》；
2、企业收到指令，在系统中向卫生处理单位提交卫生处理申请；
3、卫生处理单位收到申请，进行现场处理。处理完成后，将处理结果通过系统反馈至企业；
4、如处理异常，则不计费，退回修改。企业修改申请，卫生处理审核修改数据，将处理结果反馈至企业。
5、如处理正常，则将计费信息发至企业。
6、企业核对费用，并线下支付。
7、如费用异常，则判断是否已结算。如未结算，则计费撤回；如已结算，则卫生处理企业删单，流程结束。
8、如费用正常，卫生处理企业出证。
9、企业在系统中查看检疫处理结果和出证情况。
10、企业将检疫处理结果反馈至口岸监管部门。